2009年12月15日，穗深城际铁路将正式开通运营，成为沟通广州、东莞、深圳三市的快速轨道交通通道。

穗深城际铁路在新塘南站经既有广深城际铁路接入广州东站，乘客从广州市内交通枢纽广州东站到深圳机场站最快仅需1小时11分钟，从新塘南站到东莞西站最快仅需11分钟，从新塘南站到深圳机场站最快仅需53分钟。

穗深城际铁路正线全长73.996公里，设计时速140公里/小时。全线设新塘南站、中堂站、望牛墩站、东莞西站、洪梅站、东莞港站、厚街站、虎门北站、虎门东站、长安西站、长安站、沙井西站、福海西站、深圳机场北站、深圳机场站共15个车站。穗深城际铁路票价与广深城际铁路票价基本相当。

开通运营初期，穗深城际铁路每日最多开行37趟动车组列车，其中广州东站往返深圳机场站33趟，新塘南站往返深圳机场站4趟。日常开行33趟，其中广州东站往返深圳机场站29趟，新塘南站往返深圳机场站4趟。

穗深城际铁路是连接广州中心区、东莞核心组团、深圳西部滨海地区的城际轨道骨干线路，串联了珠江东岸各大经济发达城市组团，为构建粤港澳大湾区“1小时经济生活圈”、打造世界级城市群发挥重要作用。

此外，大湾区另一条重要城际铁路——珠机城际铁路一期(拱北至横琴段)也即将通车。元旦春节打算到珠海旅游的朋友，或将可经珠机城际铁路直达珠海热门景点长隆度假区。